Variation phénotypique cours

Plasticité phénotypique

= babies born above 3000m are smaller. Have blood richer in red blood cells.

Too much sun and light skin:
Flavines carotenoids tocopherol folates sont sensible à la photodegradation

Folates - mineralisation osseuse et maturation neurocérébrale (Neural Tube Defects)

Also leads to male infertility

Vit D agit comme hormone et régule l'absorption du Ca. Not enough Vit D = Rickets

Map of skin pigmentation indicates the oldness of African habitation and the newness of American habitation. Ex: there wasn't enough time for amazonians to adapt to high UV levels as the Congolese have.

Peuplement d'Amerique notes

Amerique (Amerigo Vespucci)

Etablir migration par données biologique:

1. Caracteres discrets morphometrie
2. Groupe sanguins
3. ADN

Stade 2 Last Glacial Maximum (LGM) - Baisse du niveau de la mer (120m)
Stade 1 Holocene (10kya)

18000ya Bering Strait is a plain. Vers 9000 l'etroit se forme.

à 18-20kya Il y a du gibier, il fait plus doux qu'aujourd'hui

Did they enter by the Ice Free Corridor or along the coast? Probably the easiest around 10ky.

Mélange = Admixture

Quatrefages: le mélange est une source de progrès et le moteur de l'Humanité

Cavalli-Sforza 1997

LD
New mixtures, new hybrids have higher levels of linkage disequilibrium.

Sex Biased Mixture, Sex-Specific Admixture
Ex: Colonial explorers were mostly men.

Cohen Y-Chromo...

If you want a bourse, work on Basque genetics!

Logiciels
Adimix95
Adimix.pas
Admix 2.0
Mitsura

What is agriculture?

1. Sédentarisme 
2. Domestication des animaux et des plantes 
3. Preparation du sol 
4. Croisements sélectifs 
5. Propagation 
6. Protection des céréales 
7. Récolte 
8. Stockage 
9. Esclavage
10. Malnutrition, diète monotone
11. Zoonoses
12. Maladies infectieuses

Test Tajima (Tajima's D)

Test de neutralité sélective basé sur la diversité moléculaire des échantillons.  Si marqueurs sont neutres, la difference est 0.  Si D ≠ 0, there is selection.  

D < 0, excès de variant rares

D > 0, déficit de variant rares

Bamshad et al.

STRUCTURE software

Pritchard et al 2000

• On assume qu'un certain nombre K de groupes sont présents. 
• On assume que chaque groupe est caractérisé par un groupe de fréquences d'alleles à chaque locus.

Degioanni is very skeptical of this software that is very à la mode these days. Results are too dependant on a researchers choice of groups.

Qu'est-ce que c'est qu'une population ?

"C'est un joker." - Mme Degioanni
On parle souvent de:

• Proximité géographique 
• Même langue 
• Partage réligion, culture, ethnie (moins de probabilité de mariages intergroupe)